1、銀離子抗菌劑干擾細胞壁的合成
細菌細胞壁重要組分為肽聚糖，銀離子抗菌劑中的銀離子對細胞壁的干擾作用，主要抑制多糖鏈與四肽交聯有連結，從而使細胞壁失去完整性，失去了對滲透壓的保護作用，損害菌體而達到殺菌效果。
2、銀離子抗菌劑可損傷細胞膜
銀離子抗菌劑可以損傷細菌細胞生命活動重要的組成部分，細胞膜。因此，如細胞膜受損傷、破壞，將導致細菌死亡。
3、銀離子抗菌劑抑制蛋白質的合成
在銀離子的作用下，細菌的蛋白質的合成過程變更、停止、使細菌死亡。
4、銀離子抗菌劑干擾核酸的合成
阻礙遺傳信息的復制，包括DNA、RNA的合成，以及DNA模板轉錄mRNA等。
銀離子抗菌劑是如何達到殺菌不對正常細菌造成影響？
銀離子抗菌劑之所以能殺菌而不傷害有益菌和正常細胞，是因為大部分的病原菌是單細胞微生物，是倚靠蛋白酶來維持新陳代謝，進而繁殖影響正常細胞，在這些蛋白酶之中還有一種氧代謝酶。
當銀離子遇到這種氧代謝酶時，氧代謝酶的活性會搶走銀的一個電子，使銀原子變成帶正電的銀離子，銀離子就會吸引蛋白酶中帶有負電荷的硫醇基(-SH)的特異性結合，有效地刺穿細胞壁與細胞膜外表，進一步使細菌細胞因蛋白質變性，而無法呼吸、代謝和繁殖，直至細菌死亡，達到滅菌并且不傷害正常細胞的效果。